Borussia Dortmund yang bertemu dengan wakil Austria, Wolfsberger AC sukses menyarangkan lima gol tanpa balas di pertandingan kedua, setelah di pertandingan pertama kedua tim hanya bermain imbang tanpa gol. Hasil ini membuat tim besutan Thomas Tuchel lolos ke babak berikutnya Europa League.
Selain Dortmund, wakil Spanyol, Athletic Bilbao juga sukses melaju ke babak berikutnya meski di laga kedua melawan wakil Azerbaijan, Inter Baki hanya ditahan tanpa gol. Di laga pertama, Bilbao sukses menang dua gol tanpa balas.
Berikut hasil lengkap babak ketiga Europa League:
Qabala 1 - 0 Apollon (Agg: 2-1)
Inter Baki 0 - 0 Athletic Bilbao (Agg: 0-2)
Omonia Nicosia 2 - 2 Brondby IF (Agg: 2-2, Omonia unggul gol tandang)
Rubin Kazan 1 - 1 SK Strum Graz (Agg: 4-3)
Ironi Kiryat 0 - 3 Slovan Liberec (Agg: 1-5)
Artomitos 1 - 0 AIK (Agg: 4-1)
Spartak Trnava 1 - 1 PAOK (Agg: 1-2)
Slovan Bratislava 3 - 3 Krasnodar (Agg 3-5)
Vorskla 3 - 1 Zillina (Agg: 3-3, Zillina unggul gol tandang)
Istanbul 1 - 2 AZ Alkmaar (Agg: 1-4)
Dinamo Minsk 1 - 1 FC Zurich (Agg: 2-1)
Vaduz 2 - 2 FC Thoune (Agg: 2-2, Vaduz unggul gol tandang)
Omonia 2 - 2 Brondby (Agg: 2-2)
Trabzonspor 1 - 1 Rabotnicki (Agg: 1-2)
Rosenborg 3 - 1 Debrecen (Agg: 6-3)
Saint Etienne 1 - 2 Targu Mures (Agg: 4-2)
Legia Warsawa 1 - 0 Kukesi (Agg: 1-0)
AEK Larnaca 0 - 1 Bordeaux (Agg: 0-4)
Zeljeznicar 0 - 1 Liege (Agg: 1-3)
Zorya 3 - 0 Sporting Club (Agg: 5-0)
Astra 2 - 1 West Ham (Agg: 3-4)
IFK Goteborg 0 - 0 Belenenses (Agg: 1-2)
Srimsgodset 0 - 2 Hajduk Split (Agg: 0-4)
Vojvodina 0 - 2 Sampdoria (Agg: 4-2)
Vitesse 0 - 2 Southampton (Agg: 0-5)
Dortmund 5 - 0 Wolfsberger AC (Agg: 6-0)