Hasil undingan babak semifinal Liga Europa mempertemukan Shakhtar Donetsk dengan Sevilla. Sementara Villarreal akan berhadapan dengan Liverpool yang tampil mengesankan saat menyingkirkan Borussia Dortmund.
Babak semifinal ini akan berlangsung pada 28 April 2016 dan 5 Mei 2016 waktu setempat.

Dua tim yang lolos dari fase ini berhak tampil di St Jakob-Park, Basel, Swiss dalam laga bertajuk final. Pertemuan memperebutkan gelar juara akan berlangsung pada 18 Mei 2016 pukul 20.45 waktu setempat.
Seandainya lolos ke babak final, Villarreal atau Liverpool akan menjadi tim yang berstatus tim tuan rumah. Sementara Shaktar Donetsk dan Sevilla berstatus tim tamu sehingga akan tampil memakai jersey away.