Liga 2: Tak Lolos Trial, Eks Gelandang Persib Dipulangkan Sriwijaya FC

Jovan sendiri mengawali kariernya di Pekan Olahraga Pelajar Nasional (POPNAS) 2017 mewakili tim Jawa Tengah. Ajang itu ternyata berujung kesempatan emas meniti karier sepak bola di Persib Youth.

Setelah itu, Jovan Affan Al Ghony lanjut memperkuat Persib Bandung U-19 dan berhasil mempersembahkan gelar Liga 1 U-19 2018.

Musim 2019, pemain berusia 22 tahun ini memperkuat Persib Bandung pada ajang Pro Elite Academy (EPA) U-20, namun klubnya gagal melaju ke babak selanjutnya, dan terhenti di empat besar.

Memasuki 2021, Jovan meninggalkan Persib dan direkrut klub Liga 2, AHHA PS Pati FC, yang belakangan sudah berganti nama menjadi FC Bekasi City.